FEAST (fast expectation-maximization for microbial source
tracking)，一个快速准确的微生物来源追溯工具，可以用于医疗保健、公共卫生、环境研究和农业，于
2019 年发表在 Nature Methods 中。
FEAST: fast
expectation-maximization for microbial source...
要在本地配置 LaTeX 和 Visual Studio Code 环境，首先需要安装一个 LaTeX 发行版（如 TeX Live、MikTeX 或 MacTeX），它提供了编译 LaTeX 文件所需的工具；然后安装 VS Code 编辑器，并添加 LaTeX Workshop 插件，这个插件可以帮助你进行代码高亮、自动补全、实时预览等操作。安装完成后，需要在 VS Code 的设置中配置...
曼特尔检验 (Mantel Test)
是一种在统计学中常用的非参数统计方法，旨在检测两个或多个独立距离矩阵之间是否存在相关性。该方法由
Nathan Mantel 和 William Haenszel 于 1967
年首次提出，并广泛应用于生态学和微生物多样性研究等领域。相较于只能处理两列数据的相关系数，曼特尔检验能够灵活地分析单个或一组环境因子与整个微生物群落地相关性。
在应用曼特...
本示例参考Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
本文的分析方法和可视化技巧非常值得在单细胞空间转录组研究中借鉴和应用。使用模块设计，将功能分解为多个可复用的函数，全名分析单细胞空间转录组数据，从基因表达到空间关系，再到分组比较。
d For every subtype, (...
非线性最小二乘法 (Nonlinear Least Squares, NLS)
是一种常见的优化方法,用于拟合非线性模型到数据，它通过最小化观测数据与模型预测之间的残差平方和来确定模型参数的最佳值。在科学研究中，特别是在生态学、生物信息学和环境科学等领域，这种方法常用于描述复杂的非线性关系，例如物种丰度与环境变量之间的关系、病毒与宿主丰度的动态变化等。非线性最小二乘法在生态学和病毒学研究中...
