多性状 GWAS 分析 (Multi-Trait Analysis of GWAS)
mtag是一款基于 Python 的命令行工具,用于联合分析多组 GWAS summary data,该方法由 Turley 等人 2018 提出。It can also be used as a tool to meta-analyze GWAS results.
安装程序To run mtag, you...
安装程序To run mtag, you will need to have Python 2.7 installed with the following packages:
numpy (>=1.13.1)
scipy
pandas (>=0.18.1)
argparse
bitarray (for ldsc)
joblib
(Note: if you already h...
Python3.0+,一种面向对象、解释型计算机程序语言Python官方下载网址,本例以 Python-3.10.8.tgz 为例。
下载或本地上传 Python 安装包1234# https://www.python.org/downloads/source/cd /toolswget https://www.python.org/ftp/python/3.10.8/Python-3.10...
因果基因集精细定位 (Fine-mapping Of CaUsal gene Sets, FOCUS),是一种基于概率框架的精细定位方法,该算法主要目的是从转录组广泛关联研究TWAS信号中准确识别因果基因、克服传统方法在连锁不平衡 (LD) 和多效性 SNP 影响下的局限性。FOCUS 通过对基因表达预测相关性结构的建模,能够有效提取与复杂性状和疾病相关的因果基因集合,为基因筛选提供高可信度...
全基因组关联研究GWAS是一种广泛应用于检测遗传变异与复杂疾病(性状)关联的研究方法。尽管 GWAS 已经成功鉴定了大量与复杂疾病(性状)相关的遗传变异,但这些变异通过人体组织中哪些特定位置的细胞影响疾病的发生和发展,仍然是当前人类遗传学研究的未解之谜。西湖大学杨剑团队 2025 年 3 月在 Nature 上发表了Spatially resolved mapping of cells as...